一是复杂化
因为锁具本身是一种机械卡阻机构，最终还要靠机械动作来完成。而电子锁必须完成机械动作(操作)―电子转换和电子控制―机械执行这一系列过程。显然是复杂一些。
二是故障概率相对较高
电子器件一多，一复杂化。必然增加故障机率，加上电子器件怕潮湿，怕强磁电，怕强震动，使它对使用环境有一定要求。而机械锁可以通过一些措施，轻而易举避免这些弱点。一台电视机坏了可以暂时不用先送去修理，而电子锁坏了却要拒人于门外，修也无法修，让人束手无策。不少电子锁都增加了备用开锁手段或称卫师傅接口，无疑又降低了安全性。
三是电子锁必须用电
早期的电子锁耗电较多，一般用市电。2013年的集成电路电子锁耗电少，一节钮扣电池就可以维持控制部分的工作，但驱动电磁铁或马达却需要大一些的电池或者用市电。有人设想增加一套手动发电装置自行解决用电问题，又使锁具更复杂了。相比之下，机械锁就不用考虑这个问题。尽管电子锁有以上问题，但它的大密钥量和不用钥匙的优点却有极大的诱感力，吸引众多的发明家为此而努力。
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